目的 本研究旨在解析信阳水牛中与慢肌纤维向快肌纤维转化相关的肌肉因子MSTN、BDNF和DKK3的功能及其对肉质特性的影响，以期为信阳水牛品种改良提供参考。 方法 根据相关文献选取MSTN、BDNF、DKK3三个肌纤维因子，利用NCBI下载其氨基酸序列，利用MEME进行结构域预测，利用在线软件STRING分析蛋白互作情况，对其进行生物信息学分析。采集3头36月龄公牛的肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、心脏、前腿肌、后腿肌、背最长肌、皮下肌、大肠、小肠等11种组织同时进行组织表达谱分析。采集1头1日龄新生牛的背最长肌，进行分离培养，诱导其分化并进行时序表达。 结果 生物学信息学分析显示，MSTN基因编码的蛋白质含有TGF-β信号通路相关结构域，主要在骨骼肌组织中高表达。BDNF基因编码的蛋白质含有神经营养因子相关结构域，主要在神经相关组织和骨骼肌中高表达。DKK3基因编码的蛋白质含有Wnt信号通路相关结构域，主要在脂肪和肝脏组织中高表达。GO和KEGG分析进一步表明，这些基因分别富集于TGF-β信号通路、神经营养因子信号通路和Wnt信号通路。时序分化结果表明，MSTN在分化前期表达上调，随后快速下调；BDNF基因表达量呈逐渐上升的趋势，在分化晚期再次被激活上调；DKK3在原代成肌细胞分化过程中不表达。 结论 以上结果表明MSTN、BDNF、DKK3基因表达与水牛肌纤维的形成存在关联。

目的 为探究CYP17A1在小尾寒羊睾丸发育中的动态表达特征，明确其功能和表达规律，为后续深入研究提供参考。 方法 该研究分别通过不同的生物信息学软件对绵羊CYP17A1的分子特征展开研究，并构建系统发育进化树；同时，运用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）与蛋白免疫印迹（Western Blot）技术检测CYP17A1在不同月龄（2、6、12月龄）小尾寒羊睾丸中的表达情况。 结果 绵羊CYP17A1基因CDS区全长1576 bp，与山羊和牛等反刍动物亲缘关系最近，共编码509个氨基酸，CYP17A1蛋白分子式为C₂₆₀₅H₄₁₄₀N₆₉₆S₁₅，分子量为57.39 kDa，理论等电点8.60，是一种具有磷酸化位点但不存在信号肽的轻微亲水性蛋白。二级结构和三级结构均以α-螺旋、β-转角、延伸链和无规卷曲构成；CYP17A1基因和蛋白在3个时期睾丸组织中均有表达，且表达量均随着月龄增长呈逐级下降的趋势，即2月龄表达量最高，6月龄的表达量次之，12月龄的表达量最低。 结论 由此可见，CYP17A1基因影响小尾寒羊睾丸发育，并且对睾丸发育起到重要的调控作用。

目的 该试验旨在研究300日龄和900日龄蛋鸭卵巢组织转录本的差异，并筛选影响卵巢衰老的关键基因或信号通路。 方法 该试验采集300日龄青年蛋鸭和900日龄老年蛋鸭卵巢组织，通过Illumina HiSeq平台进行深度测序，并对差异表达基因（Differentially expressed genes， DEGs）进行基因本体（Gene ontology， GO）功能注释、京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes， KEGG）富集分析和实时荧光定量PCR（Quantitative Real-time PCR）验证。 结果 结果显示，900日龄和300日龄蛋鸭卵巢间共鉴定出403个基因表达存在显著差异，其中235个上调基因，168个下调基因。GO功能显著富集在代谢过程、免疫系统过程、生殖过程和转录调节活性等条目；KEGG通路显著富集在白细胞介素-17信号通路、ECM受体相互作用和花生四烯酸代谢等通路。qRT-PCR结果发现，10个基因（ADRA2B、TF、APOC3、RXRG、MMP9、GRIA4、OXTR、ATP6V1G3、TRPC5和STMN4）在900日龄和300日龄蛋鸭卵巢组织间表达变化模式与转录组测序结果一致，表明RNA-Seq结果可靠。 结论 转录组测序筛选出403个显著差异基因，其中TF、APOC3、TRPC5等基因可能与卵巢衰老相关。KEGG富集显示的白介素-17信号通路、ECM受体相互作用和花生四烯酸代谢等通路，可影响炎症反应和损伤，参与蛋鸭卵巢衰老。

目的 本研究旨在分析晋南牛保种群的遗传多样性与群体遗传结构，评估其个体间的基因组亲缘关系并进行分子选配，从而更好地保护与利用晋南牛遗传资源。 方法 试验使用牛20 K单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism，SNP）芯片对161头晋南牛（46头公牛，115头母牛）进行基因分型，分型结果经质控后用于保种群遗传多样性、群体遗传结构分析及个体间基因组亲缘关系计算，优化公牛遗传贡献以最小化下一代的近交系数，同时维持群体遗传多样性。 结果 结果表明：质控后保留17070个SNP位点，个体平均观测杂合度为0.387，平均期望杂合度为0.386，SNP多态信息含量均值为0.305。纯合性片段检测共发现1907个ROH片段，平均长度为7.754 Mb，个体平均携带12.973个ROH片段，基于ROH计算的近交系数均值为0.060。依据家系进化树，该晋南牛群体可清晰划分为8个以上家系。该群体遗传多样性为0.888。基于全基因组SNP位点构建关系矩阵，个体间亲缘关系为-0.107～0.521，而将SNP位点划分为单倍型片段构建关系矩阵，个体间的亲缘关系为0～0.269，均值为0.112。通过优化公牛的遗传贡献最小化下一代的近交系数，前10头公牛的遗传贡献占全部公牛遗传贡献的57.639%。 结论 综上，晋南牛保种群遗传多样性丰富、近交水平较低；基于单倍型计算的亲缘关系，可为晋南牛科学选配及保种利用提供参考。

目的 本研究旨在揭示DNA甲基化调控在鹅肥肝形成中的作用，以期进一步筛选和挖掘与鹅肥肝形成相关的关键代谢通路和差异甲基化基因，从而完善鹅肥肝形成的表观遗传调控机制。 方法 试验选取同批次生理状态与健康状况相同的70日龄朗德鹅，分别于填饲前期（7 d）、填饲中期（16 d）、填饲后期（25 d）随机选取3只朗德鹅进行肝脏样品采集，通过DNA甲基化组分析，进一步筛选与鹅肥肝形成相关的关键代谢通路并发掘差异甲基化基因。 结果 测序获得有效数据共266.2 G，平均Q30为87.57%，比对率约74%，CT转化效率>99.4%。在全基因组检测到的甲基化胞嘧啶中，CpG上下文类型占比约65%，甲基化水平约20%；CHG和CHH类型占比均约0.7%，甲基化水平分别约4%和1.4%。主成分分析显示各填饲阶段样本明显区分；基因功能区域中，外显子区甲基化水平最高，启动子区最低。在填饲前期与填饲中期比较组中，有524个差异甲基化区域（Differential methylated region， DMR）甲基化水平上升，427个DMR甲基化水平下降；在填饲中期与填饲后期比较组中，有432个DMR甲基化水平上升，236个DMR甲基化水平下降。前期与中期差异基因显著富集于121条KEGG通路，获得829个GO条目，其中胰岛素信号通路、FoxO信号通路等与脂质沉积密切相关，涉及MAPK10、IL6等6个基因。中期与后期差异基因富集到96条KEGG通路，获得629个GO条目，其中MAPK信号通路、FoxO信号通路等显著富集，关联基因包括MAPK10、PCK1、PLA2G4A等13个基因。 结论 DMR主要富集于脂代谢相关通路的关键基因，其形成受FoxO信号通路、脂肪细胞因子信号通路、PPAR信号通路、胰岛素信号通路等多通路的协同调控，关键候选基因MAPK10、PCK1、PLA2G4A等甲基化水平与鹅肥肝形成有关联。