中国畜禽种业 ›› 2023, Vol. 19 ›› Issue (7): 37-42.

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基于转录组测序挖掘与分析中国草原红牛和日本和牛肉质性状基因

董沛雨1, 杨国明1, 闫陈雨湄1, 陈钰1, 刘静2, 张西锋1,3,*   

  1. 1.青岛农业大学动物医学院,山东青岛 266109;
    2.青岛农业大学分析测试中心,山东青岛 266109;
    3.青岛隆铭牛业有限公司,山东青岛 260000
  • 收稿日期:2023-05-23 出版日期:2023-07-26 发布日期:2023-07-24
  • 通讯作者: *张西锋(1977—),男,山东郓城人,教授,主要从事牛种质资源保护、精准鉴定与创新。
  • 作者简介:董沛雨(2002—),男,山东莱阳人,主要从事家畜生物信息学的研究。
  • 基金资助:
    山东省重点研发计划项目(2022LZGC012)

  • Received:2023-05-23 Online:2023-07-26 Published:2023-07-24

摘要: 牛肉含有人体所需的全部氨基酸,能提供高质量的蛋白质。筛选和鉴定与氨基酸相关的功能基因对于生产高级牛肉至关重要。采用RNA-seq分析中国草原红牛和日本和牛背长肌转录组,筛选出906个上调基因,741个下调基因。基因本体和京都基因和基因组百科全书富集分析表明,差异基因参与甘油三酯生物合成过程的调控、谷胱甘肽代谢、氨基酸合成与代谢等,筛选出牛肉品质性状相关的SHMT1,GART等候选基因。该研究通过两种牛品种的转录组分析生成了一个数据集,相关结果为标记辅助选择和分子育种改良肉牛肉质性状提供了潜在的功能基因。

关键词: 肉牛, 肉质性状, 差异表达基因, 氨基酸

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